Ska du bara spela in elgitarr, så är det inga problem. En elgitarr tar väl bara upp vibrationerna från strängarna och inte något annat ljud i rummet. (plus lite störningar från en del elektronik har jag märkt)
Ska du spela in någonting med hjälp av mikrofon, till exempel sång eller akustisk gitarr, får du göra det i ett annat rum eller iallafall en bit ifrån datorn, eller inte bry dig om att det blir lite brusigt ljud. Själv spelar jag in allt inom ett par meter från fläktarna i datorn, och jag tycker inte det stör så mycket. Fast då har jag iofs en relativt tyst dator.
Men din fråga verkar vara om fläkten (eller skärmen) påverkar ljudet på något annat sätt, och då är svaret att Nej, det gör den inte.