I jämförelse med andra sequencers vet jag inte men jag tycker inte alls att det är några problem med audioinspelningen i FL. Om du ska testa den så får du setill så att du har 1. input från ljudkortet ligger på en kanal i mixern, 2. klicka på "disketten" längst ner i mixern på samma kanal för att välja var inspelningen ska hamna, 3. klicka i "rec" knappen/shift+R (kan va ctrl+R eller något liknande), 4. tryck på "play"/space för att starta inspelningen.
Lycka till!